É tudo sobre
Na batalha contra Pain, vimos Naruto derrotando certos caminhos de Pain com um único soco usando o Modo Sábio. Mais tarde, quando ele era o Kyuubi o ultrapassa, ele acertou vários socos e chutes no caminho do Deva, mas não conseguiu derrotá-lo. Porque?
1- Muito da luta das 9 caudas contra Pain do anime foi preenchimento. Por exemplo, Naruto dá 6 caudas e destrói o colar de Hashirama imediatamente após se transformar no mangá. Aposto que quase todos aqueles hits foram apenas preenchimento adicionado no anime para aumentar o tempo da luta.
Desde o início podemos perceber que Yahiko foi o principal Pain utilizado por Nagato. Isso é mostrado quando ele destrói a vila com um único ataque, o jutsu de orbe negra ... Ele atrai todos os outros poderes de Pain, fazendo-os desmaiar.
Agora, por que ele simplesmente não morreu com um soco? Além de ser uma possibilidade de preenchimento, como mencionado por outra pessoa ... Já que todas as outras dores foram destruídas, isso permitiria a Nagato colocar todo o seu poder restante dentro daquela única Dor, Naruto naquele ponto não seria capaz de mate Nagato com um único golpe.